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（一）組織擬訂全區(qū)全民健康政策，起草衛(wèi)生健康事業(yè)發(fā)展地方性法規(guī)規(guī)章草案，擬訂衛(wèi)生健康、政策、規(guī)劃，制定地方衛(wèi)生健康標準并組織實施。統(tǒng)籌規(guī)劃全區(qū)衛(wèi)生健康資源配置，指導區(qū)域衛(wèi)生健康規(guī)劃的編制和實施。制定并組織實施推進衛(wèi)生健康基本公共服務均等化、普惠化、便捷化和公共資源向基層延伸等政策措施。
（二）協(xié)調(diào)推進深化醫(yī)藥衛(wèi)生體制改革，研究提出深化醫(yī)藥衛(wèi)生體制改革方針、政策、措施的建議。組織深化公立醫(yī)院綜合改革，推進管辦分離，健全現(xiàn)代醫(yī)院管理制度，制定并組織實施推動衛(wèi)生健康公共服務提供主體多元化、提供方式多樣化的政策措施，提出醫(yī)療服務和藥品價格政策的建議。
（三）制定并組織落實疾病預防控制規(guī)劃、免疫規(guī)劃以及嚴重危害人民健康公共衛(wèi)生問題的干預措施。負責衛(wèi)生應急工作，組織指導突發(fā)公共衛(wèi)生事件的預防控制和各類突發(fā)公共事件的醫(yī)療衛(wèi)生救援。
（四）組織擬訂并協(xié)調(diào)落實應對人口老齡化政策措施，負責推進老年健康服務體系建設和醫(yī)養(yǎng)結合工作。
（五）貫徹落實國家藥物政策和國家基本藥物制度，開展藥品使用監(jiān)測、臨床綜合評價和短缺藥品預警，提出基本藥物價格政策的建議。組織開展食品安全風險監(jiān)測評估，依法制定并公布食品安全地方標準。
（六）負責職責范圍內(nèi)的職業(yè)衛(wèi)生、放射衛(wèi)生、環(huán)境衛(wèi)生、學校衛(wèi)生、公共場所衛(wèi)生、飲用水衛(wèi)生等公共衛(wèi)生的監(jiān)督管理，負責傳染病防治監(jiān)督，健全衛(wèi)生健康綜合監(jiān)督體系。依法負責職業(yè)衛(wèi)生和放射衛(wèi)生安全監(jiān)督管理工作。
（七）制定醫(yī)療機構、醫(yī)療服務行業(yè)管理辦法并監(jiān)督實施，建立醫(yī)療服務評價和監(jiān)督管理體系。會同有關部門組織實施衛(wèi)生健康專業(yè)技術人員資格準入。制定并組織實施醫(yī)療服務規(guī)范、標準和衛(wèi)生健康專業(yè)技術人員執(zhí)業(yè)規(guī)則、服務規(guī)范。
（八）負責計劃生育管理和服務工作，開展人口監(jiān)測預警，研究提出人口與家庭發(fā)展相關政策建議，完善和組織實施計劃生育政策。
（九）指導市縣衛(wèi)生健康工作，指導基層醫(yī)療衛(wèi)生、婦幼健康服務體系和全科醫(yī)生隊伍建設。推進衛(wèi)生健康科技創(chuàng)新發(fā)展。組織開展衛(wèi)生健康領域對外交流合作與援外工作。
（十）負責自治區(qū)保健對象的醫(yī)療保健工作，負責自治區(qū)重要會議與重大活動的醫(yī)療衛(wèi)生保障工作。
（十一）協(xié)調(diào)有關部門對全區(qū)艾滋病實施防控和干預，控制艾滋病的發(fā)生和蔓延。
（十二）管理自治區(qū)中醫(yī)藥管理局，指導自治區(qū)計劃生育協(xié)會的業(yè)務工作。
（十三）承擔自治區(qū)愛國衛(wèi)生運動委員會、自治區(qū)防治艾滋病工作委員會、自治區(qū)保健委員會、自治區(qū)老齡工作委員會的日常工作。
（十四）完成自治區(qū)黨委、自治區(qū)人民政府交辦的其他任務。
內(nèi)設機構分別為：辦公室、人事處、規(guī)劃處（愛衛(wèi)辦）、財務處、法規(guī)處（審批辦）、體改處、疾控處、醫(yī)政醫(yī)管處、基層處、應急辦、科教處、監(jiān)督處、藥政處、食品處、老齡處、婦幼處、職業(yè)健康處、人口家庭處、宣傳處、對外交流處、艾防處、機關黨委、離退處。
負責人：杜振宗