國家稅務總局深圳市稅務局的主要職責是：

（一）負責貫徹執(zhí)行黨的路線、方針、政策，加強黨的全面領導，履行全面從嚴治黨責任，負責黨的建設和思想政治建設工作。

（二）負責貫徹執(zhí)行稅收、社會保險費和有關(guān)非稅收入法律、法規(guī)、規(guī)章和規(guī)范性文件，研究制定具體實施辦法。組織落實國家規(guī)定的稅收優(yōu)惠政策。

（三）負責研究擬訂本系統(tǒng)稅收、社會保險費和有關(guān)非稅收入中長期規(guī)劃，參與擬訂稅收、社會保險費和有關(guān)非稅收入預算目標并依法組織實施。負責本系統(tǒng)稅收、社會保險費和有關(guān)非稅收入的會統(tǒng)核算工作。組織開展收入分析預測。

（四）負責開展稅收經(jīng)濟分析和稅收政策效應分析，為國家稅務總局和市委、市政府提供決策參考。

（五）負責所轄區(qū)域內(nèi)各項稅收、社會保險費和有關(guān)非稅收入征收管理。組織實施稅（費）源監(jiān)控和風險管理，加強大企業(yè)和自然人稅收管理。

（六）負責組織實施本系統(tǒng)稅收、社會保險費和有關(guān)非稅收入服務體系建設。組織開展納稅服務、稅收宣傳工作，保護納稅人、繳費人合法權(quán)益。承擔涉及稅收、社會保險費和有關(guān)非稅收入的行政處罰聽證、行政復議和行政訴訟事項。

（七）負責所轄區(qū)域內(nèi)國際稅收和進出口稅收管理工作，組織反避稅調(diào)查和出口退稅事項辦理。

（八）負責組織實施所轄區(qū)域內(nèi)稅務稽查和社會保險費、有關(guān)非稅收入檢查工作。

（九）負責增值稅專用發(fā)票、普通發(fā)票和其他各類發(fā)票管理。負責稅收、社會保險費和有關(guān)非稅收入票證管理。

（十）負責組織實施本系統(tǒng)各項稅收、社會保險費和有關(guān)非稅收入征管信息化建設和數(shù)據(jù)治理工作。

（十一）負責本系統(tǒng)內(nèi)部控制機制建設工作，開展對本系統(tǒng)貫徹執(zhí)行黨中央、國務院重大決策及上級工作部署情況的督查督辦，組織實施稅收執(zhí)法督察。

（十二）負責本系統(tǒng)基層建設和干部隊伍建設工作，加強領導班子和后備干部隊伍建設，承擔稅務人才培養(yǎng)和干部教育培訓工作。負責本系統(tǒng)績效管理和干部考核工作。

（十三）負責本系統(tǒng)機構(gòu)、編制、經(jīng)費和資產(chǎn)管理工作。

（十四）完成國家稅務總局和市委、市政府交辦的其他工作。

派出機構(gòu)

第一稅務分局（大企業(yè)稅收服務和管理局）。組織實施大企業(yè)稅收服務和管理工作；承擔“千戶集團”企業(yè)名冊管理、數(shù)據(jù)采集、風險應對工作；指導、考核系統(tǒng)大企業(yè)稅收服務和管理工作。

第二稅務分局（出口退稅服務和管理局）。組織實施進出口稅收管理工作，對進出口稅收具體業(yè)務問題進行解釋和處理；參與海關(guān)特殊監(jiān)管區(qū)域稅收管理工作；承擔出口退稅工作。

第三稅務分局（海洋石油稅收管理局）。組織實施海洋石油企業(yè)、金融企業(yè)稅收征管、稅源管理工作；承擔轄區(qū)內(nèi)納稅人違法違章情況的處理、行政處罰及聽證、行政復議、賠償案件及行政訴訟，調(diào)解稅收爭議工作。

第四稅務分局（反避稅調(diào)查局）。制定并實施全市反避稅相關(guān)工作計劃；統(tǒng)籌實施特別納稅調(diào)整案件調(diào)查、結(jié)果的執(zhí)行和反饋；受理實施預約定價安排；組織實施對跨國企業(yè)的監(jiān)控管理；統(tǒng)籌全市企業(yè)關(guān)聯(lián)申報審核和同期資料管理等工作。

第五稅務分局（稅收大數(shù)據(jù)和風險管理局）。組織實施信息數(shù)據(jù)和風險管理工作；承擔各類稅收數(shù)據(jù)、社會保險費和有關(guān)非稅收入數(shù)據(jù)的集中管理與分析應用；指導、考核系統(tǒng)大數(shù)據(jù)和風險管理工作。

稽查局。組織實施稅務稽查法律法規(guī)、規(guī)章及規(guī)范性文件；承擔案源管理、稅務稽查、社會保險費和有關(guān)非稅收入檢查工作；組織查辦督辦稅收重大違法案件；承擔推行“雙隨機、一公開”監(jiān)管工作；承擔稅收違法“黑名單”公布及聯(lián)合懲戒工作；組織落實稅務部門和公安部門聯(lián)絡機制；參與實施“一案雙查”。

第一稽查局。承擔列名大企業(yè)的稅務稽查、稅收高風險事項應對和協(xié)查等工作；承擔市局稽查局分派稅務案件的查辦工作；負責深圳市羅湖區(qū)、福田區(qū)、鹽田區(qū)及海洋石油稅收管理局征收管理范圍內(nèi)稅收、社會保險費和有關(guān)非稅收入違法案件的查處以及查辦案件的執(zhí)行工作。

第二稽查局。承擔列名大企業(yè)的稅務稽查、稅收高風險事項應對和協(xié)查等工作；承擔市局稽查局分派稅務案件的查辦工作；負責深圳市南山區(qū)、蛇口、前海自貿(mào)區(qū)、龍華區(qū)管轄區(qū)域內(nèi)稅收、社會保險費和有關(guān)非稅收入違法案件的查處以及查辦案件的執(zhí)行工作。

第三稽查局。承擔列名大企業(yè)的稅務稽查、稅收高風險事項應對和協(xié)查等工作；承擔市局稽查局分派稅務案件的查辦工作；負責深圳市龍崗區(qū)、坪山區(qū)、大鵬新區(qū)管轄區(qū)域內(nèi)稅收、社會保險費和有關(guān)非稅收入違法案件的查處以及查辦案件的執(zhí)行工作。

第四稽查局。承擔列名大企業(yè)的稅務稽查、稅收高風險事項應對和協(xié)查等工作；承擔市局稽查局分派稅務案件的查辦工作；負責深圳市寶安區(qū)、光明區(qū)、深汕特別合作區(qū)管轄區(qū)域內(nèi)稅收、社會保險費和有關(guān)非稅收入違法案件的查處以及查辦案件的執(zhí)行工作。