根據(jù)機構(gòu)改革昌市事改發(fā)〔2014〕43號和昌市政辦發(fā)〔2012〕90號本單位承擔(dān)的職能共14項，具體是：

（一）負責(zé)《中華人民共和國水法》、《中華人民共和國水土保持法》、《中華人民共和國防洪法》、《中華人民共和國漁業(yè)法》等水法律、法規(guī)的組織實施和監(jiān)督檢查，擬定昌吉市水行政的政策措施、發(fā)展戰(zhàn)略和中長期規(guī)劃，并依法監(jiān)督實施。

（二）統(tǒng)一管理昌吉市區(qū)域內(nèi)水資源（含空中水、地表水、地下水）。組織擬定昌吉市水的中長期供求計劃、水量調(diào)配方案，對昌吉市年度用水實行總量控制并監(jiān)督實施；組織有關(guān)昌吉市國民經(jīng)濟總體規(guī)劃、城市規(guī)劃及重大建設(shè)項目的水資源和防洪論證工作；組織實施取水許可證制度和水資源費征收制度。負責(zé)組織實施昌吉市水資源動態(tài)監(jiān)測工作，定期向州水利部門上報。

（三）負責(zé)昌吉市水政監(jiān)察和水行政執(zhí)法工作；協(xié)調(diào)并仲裁昌吉市境內(nèi)水事糾紛。    

（四）擬訂實施節(jié)約用水政策，負責(zé)區(qū)域內(nèi)節(jié)約用水管理工作，建立和完善節(jié)水制度，負責(zé)城鄉(xiāng)規(guī)劃區(qū)地下水資源的管理保護，監(jiān)督指導(dǎo)城鄉(xiāng)采水和管網(wǎng)輸水、用戶用水中的節(jié)約用水工作；監(jiān)督管理節(jié)約用水工作。

（五）按照國家資源與環(huán)境保護的有關(guān)法律法規(guī)和標(biāo)準(zhǔn)，負責(zé)實施區(qū)域內(nèi)水資源保護規(guī)劃，組織水功能區(qū)的劃分和向飲水區(qū)等水域排污的控制；監(jiān)測河庫水量、水質(zhì)，監(jiān)測地下水水位、水質(zhì)、水溫并定期向上級報告；審定水域納污能力，提出限制排污總量的意見。

（六）擬訂水利、水電、的經(jīng)濟調(diào)節(jié)措施，管理和監(jiān)督水利部門的國有資產(chǎn)的保值、增值，對水利資金的收繳、使用和管理進行監(jiān)督檢查。負責(zé)全市水利行業(yè)的供水、水產(chǎn)及多種經(jīng)營工作；會同有關(guān)部門研究提出有關(guān)水利的價格、稅收、信貸、財務(wù)等經(jīng)濟調(diào)節(jié)意見。

（七）負責(zé)編制、審查、申報昌吉市轄區(qū)內(nèi)水利基本建設(shè)項目建議書和可行性研究報告及初步設(shè)計，負責(zé)監(jiān)督實施水利行業(yè)技術(shù)質(zhì)量標(biāo)準(zhǔn)和水利工程的規(guī)程、規(guī)范；負責(zé)編審上報和實施全市水利基本建設(shè)及各類水利專項建設(shè)前期工作的年度投資計劃。

（八）負責(zé)全市水利設(shè)施、水域及其岸線的管理與保護；負責(zé)昌吉市三屯河水庫及其下游河道的綜合治理和開發(fā)利用工作；承擔(dān)全市水利工程的建設(shè)和管理責(zé)任；負責(zé)水庫、水電站大壩的安全監(jiān)管；管理農(nóng)牧區(qū)水利、鄉(xiāng)鎮(zhèn)供水、人畜飲水、城市供水水源建設(shè)和水環(huán)境保護等工作，主管全市農(nóng)田水利基本建設(shè)工作；負責(zé)引進和推廣水利、水產(chǎn)科學(xué)技術(shù)。

（九）負責(zé)昌吉市水土保持工作。研究制定水土保持工程措施規(guī)劃，組織實施水土流失的監(jiān)測和綜合防治。

（十）負責(zé)昌吉市防汛抗旱總指揮部的日常工作，主管昌吉市防洪抗旱工作；負責(zé)昌吉市防洪抗旱減災(zāi)工作。

（十一）負責(zé)權(quán)限內(nèi)建設(shè)項目水資源論證報告書、水利基建項目初步設(shè)計文件、水利工程開工、填堵、占用或拆毀江河的故道、舊堤、原有工程設(shè)施等、水庫大壩管理范圍和保護范圍內(nèi)修建碼頭、魚塘、開墾禁止開墾坡度以下、五度以上荒坡地的審批；負責(zé)權(quán)限內(nèi)取水、河道采砂許可；負責(zé)權(quán)限內(nèi)河道管理范圍內(nèi)建設(shè)橋梁、碼頭和其他攔河、跨河、臨河建筑物、構(gòu)筑物,鋪設(shè)跨河管道、電纜工程建設(shè)方案的審查；負責(zé)山區(qū)、丘陵區(qū)、風(fēng)沙區(qū)開發(fā)建設(shè)項目水土保持方案審核及水土保持設(shè)施的驗收。

（十二）負責(zé)用水定額的審核；負責(zé)水利信息化工作。

（十三）承辦昌吉市人民政府交辦的其他事項。