新疆巴音郭楞蒙古自治州農(nóng)業(yè)科學研究院主要職責：

以科技創(chuàng)新為引領，承擔自治州主要農(nóng)作物新品種選育、引進和高產(chǎn)栽培技術(shù)研究以及新成果、新技術(shù)、新產(chǎn)品的示范、推廣轉(zhuǎn)化；借助當?shù)鬲毺氐淖匀粭l件和氣候條件，對種植業(yè)品種種質(zhì)資源開展長期的征集、研究、保存和利用；對種植業(yè)、特色林果業(yè)、優(yōu)勢產(chǎn)業(yè)的病蟲害發(fā)生規(guī)律和綜合防治技術(shù)開展研究；對設施農(nóng)業(yè)開展綜合研究；解答上級黨委、政府及當?shù)攸h政部門對自治州農(nóng)業(yè)問題的咨詢；對自治州農(nóng)業(yè)重大災情、病蟲情發(fā)生預警和救災預案的提出；農(nóng)業(yè)科學知識普及，農(nóng)牧民科技培訓等