負責機關日常運轉，承擔文秘、信息、宣傳、政務公開、制度建設、信訪、會務、接待、機要、保密、檔案、安全、后勤等工作。組織起草綜合性材料、重要文件。承擔人大政協建議提案、領導重要批示件督辦工作。承擔信息化建設工作。

承擔機關和下屬單位的組織人事、機構編制、隊伍建設、教育培訓等工作。承擔紀檢聯絡、統戰(zhàn)工作。承擔離退休人員服務管理工作。負責機關和下屬單位黨的建設和群團工作。

提出扶持農業(yè)農村、林業(yè)水利發(fā)展的財政政策和資金項目建議，組織提出農業(yè)林業(yè)水利投資規(guī)模、方向的建議并監(jiān)督實施。參與農村金融政策制定。承擔機關和部門預決算編制、執(zhí)行和監(jiān)督，以及財務、資產管理、政府采購、小額公共資源交易、非稅收收入、內部審計和績效評價等工作。指導、監(jiān)督下屬單位的財務工作。參與專項轉移支付資金管理工作。

指導推動農業(yè)林業(yè)科技體制改革及相關體系建設、技術研發(fā)、成果轉化和技術推廣工作。組織協調水利科研項目攻關和科技成果的推廣應用。監(jiān)督管理農業(yè)、林業(yè)轉基因生物安全。承擔推動農業(yè)綠色發(fā)展有關工作。承擔外來物種管理相關工作。指導農村可再生能源開發(fā)利用、節(jié)能減排、農業(yè)清潔生產和生態(tài)循環(huán)農業(yè)建設，指導農產品產地環(huán)境保護和管理。負責農業(yè)教育和職業(yè)農民培育。指導農業(yè)農村人才隊伍建設。

保護和合理開發(fā)利用漁業(yè)資源，指導水產健康養(yǎng)殖和水產品加工流通。組織水生動植物病害防控。監(jiān)督管理捕撈業(yè)，組織實施禁漁期（區(qū)）制度。組織實施漁港建設，負責漁船漁港監(jiān)督管理。指導漁業(yè)互助保險。牽頭組織漁場修復振興工作。

承擔本部門“最多跑一次”改革和行政審批制度改革相關工作。組織擬訂行政審批工作依據、辦理程序、業(yè)務流程、審核標準和規(guī)則。承擔農業(yè)、林業(yè)、水利等行政審批工作，承擔審批文書的制定、送達、歸檔工作。綜合協調本部門有關科室規(guī)范開展行政審批的相關延續(xù)工作。參與行政審批服務過程中出現的各類投訴的調查工作。

參與區(qū)縣協作工作。提出幫扶工作的重大政策和項目建議并組織實施。銜接其他重點幫扶工作。承擔農村工作指導員有關工作。承擔區(qū)扶貧開發(fā)領導小組辦公室、區(qū)聯鄉(xiāng)結村協調小組辦公室的日常工作。協調推進鄉(xiāng)村治理體系建設。承擔農民承包地改革和管理、農村集體產權制度改革、農業(yè)農村改革試驗區(qū)有關工作。指導農村宅基地改革有關工作。管理、監(jiān)督減輕農民負擔工作。指導農村集體經濟組織的資產和財務管理。

保護和合理開發(fā)利用漁業(yè)資源，指導水產健康養(yǎng)殖和水產品加工流通。組織水生動植物病害防控。監(jiān)督管理捕撈業(yè)，組織實施禁漁期（區(qū)）制度。組織實施漁港建設，負責漁船漁港監(jiān)督管理。指導漁業(yè)互助保險。牽頭組織漁場修復振興工作。